A Química Computacional - Grupo de Bioquímica Computacional
Faculdade de Ciências, Universidade do Porto
PROTEÓMICA COMPUTACIONAL
As
proteínas são as macromoléculas mais abundantes do nosso organismo.
Existem milhares de proteínas diferentes em cada uma das nossas
células, a desempenhar as mais variada funções. Podem ser elementos
estruturais das células, transmitir sinais do meio extracelular para o
meio intracelular, catalizar reacções químicas, actuar como agentes de
defesa contra invasores patogénicos, etc.
No Grupo de Bioquímica Computacional temos vindo a simular um grande número de proteínas para a) prever a sua estrutura, b) prever a energia de associação entre proteínas e ligandos, c) prever como é que as proteínas se associam entre si, etc.
A figura abaixo representa a protease do HIV-1 em complexo com um fármaco. As simulações de proteínas permitem prever como é que ambos se associam, com que energia se associam e quais são as condições necessárias para haver uma boa associação. O fármaco é uma agente antiretroviral e a sua eficiência depende da sua capacidade para se associar fortemente à protease do HIV-1.
No Grupo de Bioquímica Computacional temos estudado um grande número de proteínas.
Para mais informações sobre os nossos estudos a este nível consulte o portal do grupo.
No Grupo de Bioquímica Computacional temos vindo a simular um grande número de proteínas para a) prever a sua estrutura, b) prever a energia de associação entre proteínas e ligandos, c) prever como é que as proteínas se associam entre si, etc.
A figura abaixo representa a protease do HIV-1 em complexo com um fármaco. As simulações de proteínas permitem prever como é que ambos se associam, com que energia se associam e quais são as condições necessárias para haver uma boa associação. O fármaco é uma agente antiretroviral e a sua eficiência depende da sua capacidade para se associar fortemente à protease do HIV-1.
Modelo molecular da enzima Protease do HIV-1 associada a um fármaco.
Clique sobre a imagem para visualizar uma animação da proteína.
Clique sobre a imagem para visualizar uma animação da proteína.
No Grupo de Bioquímica Computacional temos estudado um grande número de proteínas.
Para mais informações sobre os nossos estudos a este nível consulte o portal do grupo.